Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVOPQ8N4V2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms