Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD163Q86VB7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms