Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms