Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms