Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSL3PQ5NE16 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms