Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA8Q53HL2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA8Q53HL2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms