Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms