Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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