Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms