Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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