Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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