Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL19A1Q14993 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms