Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSPNQ14714 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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