Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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