Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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