Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms