Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms