Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms