Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms