Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO3P55854 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms