Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms