Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms