Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD1P0DJD0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms