Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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