Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFP01375 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFP01375 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFP01375 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFP01375 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms