Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms