Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms