Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms