Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms