Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms