Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL3Q9BXA9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms