Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms