Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms