Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL22A1Q8NFW1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL22A1Q8NFW1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms