Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms