Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms