Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCQ7RTU9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms