Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms