Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LDLRAP1Q5SW96 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms