Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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