Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF212Q495C1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms