Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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