Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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