Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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