Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms