Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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