Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms