Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms