Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms