Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms